长期以来，生产、运输、销售中的不确定环节，让农产品时常面临“通而不畅”“产而难销”“运而有损”“丰而不富”等难题。对此，农村电商中的新理念、新技术、新模式，能够有效提高农产品供应链的质量和效率，农业产业链“全链触网”势在必行。
传统的农产品供应链依赖于全国各地的农产品生产、加工企业或采购商，其特点是数量多、规模较小、组织化程度低、需求分散。这种特点，造成了农产品在流通中要经过多次运输和交易环节，从而极大增加了农产品的损耗与成本，无法充分保障农民和消费者的利益。
从生产环节来看，农产品的生产要根据季节来安排，而且产地也普遍分布在不同的地方。但城市的需求却每天都在产生，由于信息不对称，容易使供需关系失衡，从而造成一定损失。
针对此类问题，相关政府部门或协会应积极与企业合作，构建各类线上农产品平台，建立农产品提供者、销售平台、消费者三方信息融合的供应链。
该平台不但包括“种植户+农贸市场”“农业基地+超市”“农产品加工企业+零售商”等农产品供应链新模式，而且还有产地行情、品种、数量、价格等相关信息，从而充分整合农产品供应链的两端。
对于农户建立的网上微店，平台也应进行整合，形成电子商务农产品供应链服务模式。农户可以利用多种线上平台与第三方物流企业合作，直接实现农产品在农户与消费者之间的销售。中间环节的减少，无疑能够让更多农业产值留在农村，成为农民增收的重要保障。
从流通环节来看，如果农产品物流企业之间没有充分实现信息共享，就无法有效整合物流资源，导致物流成本较高且缺乏弹性。
借助农村电商，农产品供应链相关企业可以利用起网络信息平台建立协同关系，以确保供应链系统效益的最大化，进而使供应链系统逐步集成化、精益化和柔性化，优化各链条的资源配置，从而提升农产品流通的整体效率。
为此，必须持续优化、提高实体终端的服务水平，发展智能物流。
短期内，通过优化实体终端的分布，可以提升配送服务的运营效率，提高农产品配送水平。同时，通过不同种类功能的实体终端优化，还可以提高农产品在仓储环节的质量。
长期来说，随着科技的发展，未来的物流将向着智能物流方向发展。智能物流不但可以大范围地提高冷链物流，保证农产品的质量及新鲜度，而且通过无人机送货、配送机器人等的普遍化，还可以实现高效快速的农产品配送，从而有效避免农产品运输中造成的耗损和质量问题，保证农产品供应链的效率。因此，要不断增加对智能物流的投入力度。
另外，针对农产品保存期短、极易变质的特点，可以通过信息化平台实现对海量农产品安全信息的收集与共享，实现对农产品质量管理的精细化、全程化、常态化。
具体说来，对于整个农产品供应链，其各个环节都可以借助互联网技术进行信息的采集与共享，从而形成从头至尾的溯源监管。
例如，可以通过采用高效低成本的二维码技术，做好农产品相关信息的整理、分析、评估、预警，实现对各类农产品的种植、加工、流通、仓储及零售等各个环节的监控，保证供应链全程追溯，做到“一码溯源”。
在消费端，网络技术也可以优化农产品的信息管理，提升消费者购买信心。例如，可以鼓励消费者下载相关手机软件，通过扫描农产品包装袋上的二维码，查询和追溯农产品相关的产地及质量检测等安全信息，从而让消费者可以高效便捷地增加对农产品的了解。
在品牌塑造上，农产品监管部门和相关企业也可以借助网络平台的力量，强化信息公开，传播农产品的有关知识，纠正不科学的安全观念，化解对农产品安全的信任危机，减少谣言和误传，让消费者更加放心，激活更多潜在消费力量。